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文獻(xiàn)分享丨JPR血清還是血漿？
血樣的采集具有低侵襲性，且含有豐富的生物信息等優(yōu)點(diǎn)，是代謝組學(xué)臨床研究的首選生物體液。然而，采血管的選擇對(duì)血漿和血清代謝物的準(zhǔn)確定量有不可否認(rèn)的影響。來自意大利佛羅倫薩大學(xué)的Claudio Luchina團(tuán)隊(duì)進(jìn)行了相應(yīng)的比較，結(jié)果于2022年3月份發(fā)表在Journal of Proteome Research雜志上，文章標(biāo)題為“Serum or Plasma (and Which Plasma), That Is the Question”。
簡(jiǎn)介
血液常處理為血漿和血清的形式，且是一般臨床研究的首選生物流體，特別是在代謝組學(xué)和脂質(zhì)組學(xué)方面。血液采集時(shí)侵入性低，生物信息豐富。血液衍生物包含不同組織對(duì)各種生理刺激、條件或應(yīng)激源所分泌的代謝物和脂蛋白。因此，血清和血漿對(duì)健康或疾病條件、遺傳變異、環(huán)境因素、生活方式、營(yíng)養(yǎng)習(xí)慣和藥物都很敏感，它們可以在系統(tǒng)水平上提供重要的信息。由于所有的這些原因，血液衍生物經(jīng)常被收集，以供未來的科學(xué)研究使用。然而，由于分析前階段對(duì)人的代謝組/脂蛋白質(zhì)譜的穩(wěn)定性和組成有較大影響，只有合理采集和儲(chǔ)存的血清或血漿樣本才能代表真實(shí)且重要的健康資源。
研究結(jié)果
作者使用3種不同的采血管（EDTA血漿、檸檬酸鹽血漿和血清管）收集了來自4名健康女性和2名健康男性，共23份血樣（如圖1），并將所有的血樣使用配備有控溫功能的自動(dòng)進(jìn)樣器（SampleJet）的600MHz核磁共振譜儀在310K的溫度下進(jìn)行檢測(cè)，共測(cè)出24種小分子代謝物、2種糖蛋白和112種脂蛋白。
一般來說，血清樣品中的氨基酸水平往往高于另兩種血漿樣品。造成這樣的結(jié)果可能是由于：1）這兩種抗凝劑對(duì)血漿蛋白水解活性都有部分抑制作用；2）在采集血清樣本的凝血步驟中，一些代謝物可能被活化的血小板釋放，從而增加了它們的含量。
在血清中，觀察到較兩種血漿樣本更高的乳酸水平以及降低的丙酮酸水平。這種現(xiàn)象已初步歸因于在血清與血細(xì)胞分離之前即凝血時(shí)間內(nèi)的持續(xù)糖酵解。丙酮、乙酸和甲酸也顯示在血清樣品中減少，這與之前的研究結(jié)果一致。有研究報(bào)道，乙酸和甲酸作為污染物存在于 EDTA 等離子管中。關(guān)于丙酮，研究人員提出這是由于在血液等分階段引入的污染。然而，本文作者懷疑丙酮、乙酸和甲酸可能是從塑料中釋放出來或存在于檸檬酸鹽血漿采集管的抗凝溶液中。
此外，作者還觀察到與血清相比，檸檬酸鹽血漿中的肌酐水平降低。與檸檬酸鹽血漿相比，EDTA 血漿樣品顯示出更高水平的三甲胺-N-氧化物和肌氨酸。此外，二甲基砜在所分析的所有三個(gè)采血管中顯示出顯著差異。檸檬酸鹽血漿、EDTA 血漿和血清的相關(guān)分析中指出了幾個(gè)統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著差異的代謝物。琥珀酸、乙酰乙酸和 3-羥基丁酸在兩種血漿樣品中都高度相關(guān)，而這些關(guān)系在血清樣品中部分丟失。亮氨酸與檸檬酸鹽血漿中的 3-羥基丁酸鹽顯著抗相關(guān)，而 EDTA 血漿和血清中不存在相關(guān)性。谷氨酰胺、甘氨酸和組氨酸在血清中呈強(qiáng)正相關(guān)；然而，它們?cè)趦蓚�(gè)血漿樣本中都部分丟失了。
作者還檢查了糖蛋白區(qū)域的積分，與 EDTA 血漿和血清樣品相比，檸檬酸鹽血漿樣品中的 GlycA 和 GlycB 均顯示顯著降低。此外，與血清樣品相比，EDTA 血漿中的 GlycA 也呈現(xiàn)出統(tǒng)計(jì)學(xué)上顯著的降低。 GlycA 和 GlycB 是與炎癥密切相關(guān)的生物標(biāo)志物，可預(yù)測(cè)心血管事件；因此，當(dāng)需要測(cè)量這些糖蛋白時(shí)，應(yīng)該考慮上述現(xiàn)象造成的影響。
2 不同采血管對(duì)脂蛋白譜的影響
從單變量分析中可以看出，與 EDTA 血漿和血清樣品相比，檸檬酸鹽血漿樣品的脂蛋白水平通常降低（圖 3）。與血清樣本相比，檸檬酸鹽血漿中 112 個(gè)脂蛋白相關(guān)參數(shù)中的 46 個(gè)顯著降低，5 個(gè)參數(shù)顯著增加（甘油三酯 LDL-3、VLDL-5膽固醇、VLDL-5游離膽固醇、VLDL-5磷脂、VLDL-5甘油三酯）。在這 51 項(xiàng)脂蛋白相關(guān)參數(shù)中，有 42 項(xiàng)在檸檬酸鹽和 EDTA 血漿之間的比較中也顯示出顯著變化；此外，與檸檬酸鹽血漿樣品相比，EDTA 樣品中的其他六個(gè)組分（LDL-4、LDL-4膽固醇、LDL-5膽固醇、LDL-4游離膽固醇、LDL5磷脂、LDL-4 Apo-B）顯著升高。相反，與血清樣本相比，EDTA 血漿樣本僅降低了 5 個(gè)脂蛋白相關(guān)參數(shù)（LDL-2游離膽固醇、HDL-1膽固醇、HDL-1游離膽固醇、HDL-1磷脂、HDL-1 Apo-A1）。
3 通過統(tǒng)計(jì)方法減少血清與血漿的差異
在代謝組學(xué)和脂蛋白譜研究中必須對(duì)不同的血液基質(zhì)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析時(shí)，因不同采血管造成的影響變得至關(guān)重要。作者通過分析殘差矩陣，通過指示收集管的分類變量（分類“檸檬酸鹽血漿”編碼為值1，“EDTA血漿”編碼為值2，“血清”編碼為值3）與代謝物或脂蛋白濃度的連續(xù)變量之間的回歸來解決。此方法可以有效地減少不同收集管對(duì)代謝產(chǎn)物和脂蛋白譜的 PCA 空間分離(圖 4A和B) : 在原始的 PCAs 中，三組代謝產(chǎn)物和脂蛋白的Calinski-Harabasz 指數(shù)（CH越大代表著聚類越緊密，類與類之間越分散）分別為16.1和1.4，在殘差計(jì)算的 PCAs 中，CH 值分別下降到4.9 × 10-32和1.5 × 10-31。通過血樣個(gè)體來源的PCA可以觀察到每個(gè)受試者聚集在她/他的 PCA 子空間中（圖 4C，D）。因此，作者假設(shè)，盡管此方法引起了原始數(shù)據(jù)的強(qiáng)烈變化，但它們的生物學(xué)和生理特性是保守的。
全文總結(jié)
采血基質(zhì)的選擇對(duì)于從代謝組學(xué)和脂蛋白組學(xué)數(shù)據(jù)中獲得有意義的生物學(xué)推斷至關(guān)重要。本文的數(shù)據(jù)強(qiáng)調(diào)了使用不同的采血管時(shí)發(fā)生的變化和生化反應(yīng)是不同的。血漿和血清樣本不僅在抗凝劑的核磁共振峰上有所不同，而且大多數(shù)代謝物在不同基質(zhì)中的相關(guān)關(guān)系也不同。脂蛋白譜中也存在一些差異。因此，在規(guī)劃前瞻性研究時(shí)，應(yīng)避免使用不同的采集管，即使是在相同的血液基質(zhì)中，當(dāng)使用不同的采集管從不同中心采集樣本時(shí)，應(yīng)在多中心或回顧性研究中仔細(xì)考慮。
以上文章轉(zhuǎn)自iMtabolome公眾號(hào)，作者王琪。
