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合作文章丨J Pharm Anal;鈮A定量方法開發(fā)
;鈮A主要來源于線粒體、過氧化物酶體和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中的脂肪酸和支鏈氨基酸。根據(jù);滈L度可分為短鏈(C2-5)、中鏈(C6-12)、長鏈(C13-20)和超長鏈(> C20);鈮A,其中部分;鈮A的酰基鏈上含有羥基、羧基或側(cè)鏈甲基,或與許多親水性化合物(包括氨基酸、葡萄糖醛酸和磺酸)共軛。這些;鈮A不僅在脂質(zhì)和氨基酸的代謝穩(wěn)態(tài)、脂肪酸運(yùn)輸和宿主-微生物共生等方面發(fā)揮著重要作用,而且部分;鈮A作為2型糖尿病、心血管疾病、阿爾茨海默病、非酒精性脂肪性肝病、腫瘤和先天性代謝缺陷的生物標(biāo)志物。然而,各種;鈮A的結(jié)構(gòu)和物理化學(xué)性質(zhì)存在巨大差異,目前仍然缺乏高通量高覆蓋的;鈮A定量方法用于支鏈、羥基化、羧化和共軛;鈮A的功能研究。
超高效液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用法(UPLC-MS)在同時(shí)定性定量;鈮A方面具有巨大的潛力。超高效液相色譜-高分辨率質(zhì)譜法(UPLC-HRMS)受限于掃描速度和動(dòng)態(tài)范圍,故對于含有多不飽和、羥基化和羧化酰基鏈的低豐度;鈮A具有較低的定性定量準(zhǔn)確性。相對地,多反應(yīng)監(jiān)測模式(MRM)目前作為超高效液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜(UPLC-MS/MS)定量分析的最佳選擇,存在熱不穩(wěn)定性、覆蓋度低、通量低或異構(gòu)體區(qū)分有限等問題。因此,所有報(bào)道的UPLC-MS/MS方法只覆蓋了少數(shù)羥基化和羧化的;鈮A,而沒有共軛的酰基肉堿。此外,基于UPLC-MS/MS的高覆蓋;鈮A定量方法的主要瓶頸之一是缺乏可靠的標(biāo)準(zhǔn)品來獲得所有可能的酰基肉堿的保留時(shí)間(tR)。然而,定量結(jié)構(gòu)-保留關(guān)系(QSRR)建模雖然有助于預(yù)測;鈮AtR,但這類研究只考慮了;溕系奶荚雍碗p鍵數(shù)量。
復(fù)旦大學(xué)人類表型組研究院分子表型代謝組平臺唐惠儒教授團(tuán)隊(duì)首先開發(fā)了一種基于UPLC-MS/MS結(jié)合MRM采集模式的定量方法,可用于在10分鐘內(nèi)同時(shí)定量生物體液和組織中所有可識別的;鈮A。然后,利用;鈮A7個(gè)結(jié)構(gòu)特征,構(gòu)建了其tR值的QSRR模型用于預(yù)測更多;鈮A的tR值,從而進(jìn)一步建立了文獻(xiàn)中檢測到的1136種;鈮A的MRM參數(shù)(tR、MRM離子對與碰撞能量值)數(shù)據(jù)庫。最后,該團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步定量了兩種典型人體生物體液(血漿和尿液)和五種典型動(dòng)物模型組織中的;鈮A,以揭示其分子表型特征。
研究方法
首先,采用異丙醇/水溶液提取不同生物基質(zhì)中;鈮A。再者,采用UPLC-QTOFMS定性分析酰基肉堿標(biāo)準(zhǔn)品的tR與特征碎片,并鑒定出不同生物基質(zhì)中酰基肉堿種類。然后,基于R語言中LM函數(shù)來構(gòu)建;鈮AtR值的QSRR預(yù)測模型、并建立文獻(xiàn)中檢測到的1136種酰基肉堿的MRM參數(shù)(tR、MRM離子對、碰撞能量)數(shù)據(jù)庫。最后,經(jīng)方法學(xué)考察,對多種生物基質(zhì)中;鈮A進(jìn)行定量分析與分子表型描述。
研究內(nèi)容
1. 基于UPLC-QTOFMS多種基質(zhì);鈮A分析
相比負(fù)離子模式,在正離子模式下所有;鈮A均產(chǎn)生更強(qiáng)烈的信號,包括母離子[M]+(源于左旋肉堿季銨陽離子)、[M-59.0735]+(N(CH3)3的中性損失)和來自左旋肉堿部分的三個(gè)特征碎片(m/z 144.1019、85.0284和60.0808)。同時(shí),所有共軛;鈮A均產(chǎn)生母離子[M]+、[M-共軛物-59.0735]+和來自肉堿部分的三個(gè)特征碎片。由于特征碎片m/z 85.0284響應(yīng)值均最強(qiáng),故 [M]+/85.0284可作為;鈮A的MRM定量離子對。[M-共軛物-59.0735]+是共軛;鈮A唯一的高響應(yīng)特征碎片,故[M]+/[M-共軛物-59.0735]+可用于作為定量MRM離子對;谏鲜鯩RM定性定量分析方法,多種生物基質(zhì)(兔肝組織、人源血漿、尿液和細(xì)胞)及其混合樣品中鑒定出471種酰基肉堿,其中包括395種;鈮A和76種共軛;鈮A。
圖1 (A)酰基肉堿(C10:0)與(B) N -乙酰半胱氨酸共軛-羥基;鈮A(N-acetylcys-C10:1-OH-CA)在正離子模式下的碎裂模式。
2. ;鈮A定量結(jié)構(gòu)-保留關(guān)系(QSRR)和MRM參數(shù)數(shù)據(jù)庫
利用R語言中LM函數(shù)構(gòu)建了該色譜條件下;鈮A的QSRR模型(式3),45種;鈮A標(biāo)準(zhǔn)品的計(jì)算保留時(shí)間(tRC)與實(shí)驗(yàn)結(jié)果(tRE)具有良好的線性相關(guān)性(r2> 0.998)和準(zhǔn)確性(△tR< 0.20 min,MAE < 0.07 min)。該模型對于混合樣品中檢測到的所有211個(gè);鈮A均具有良好的tRC與tRE相關(guān)性(r2 ~ 0.984)和預(yù)測精度(MAE< 0.21 min和△tR < 0.9 min),其中包括不同;兼、支鏈甲基、碳碳雙鍵、羥基或羧基數(shù)目的;鈮A。即使在這些結(jié)構(gòu)特征同時(shí)存在的情況下,從混合樣品中鑒定出97%酰基肉堿的tRC與tRE相關(guān)性和準(zhǔn)確性均優(yōu);诖,一個(gè)MRM參數(shù)(tR、MRM離子對和碰撞能量)數(shù)據(jù)庫被進(jìn)一步建立,其中涵蓋了含398個(gè)化學(xué)結(jié)構(gòu)式的1136種;鈮A(包括;鈮A、共軛肉堿及其異構(gòu)體)。
tRC = k0 + k1c3 + k2c2 + k3c + k4b+ k5d + k6h + k7j+ k8p + k9q+ k10ch (式 3)
(其中,k0 = –0.252, k1 = 8.54×10–4, k2 = –4.82×10–2, k3 = 1.06, k4 = –0.487, k5 = –0.172, k6 = –1.65, k7 = –1.55, k8 = 0.152, k9 = –1.59×10–2與k10 = 7.20×10–2。模型中變量c、b、d、h、j分別表示;溙、支鏈甲基、碳碳雙鍵、羥基、羧基的個(gè)個(gè)數(shù),p、q表示支鏈和雙鍵的位置。)
圖2(A)45個(gè);鈮A標(biāo)準(zhǔn)品與(B)生物樣品中檢測到的酰基肉堿模型計(jì)算保留時(shí)間(tRC)與實(shí)驗(yàn)結(jié)果(tRE)的比較。
3. 多種生物基質(zhì)中酰基肉堿的定量分析以表征其分子表型
在2種典型的人源生物液體(血漿和尿液)和5種小鼠組織(腎臟、肝臟、心臟、肺和肌肉)中共定量出514種;鈮A,用于表征其;鈮A分子表型。其中,人源尿液樣本中含有421種酰基肉堿多于人源血漿(149種)和小鼠組織(包括腎211種、肝195種、心臟189種、肺188種與肌肉169種),特別是共軛;鈮A與含有羥基和羧基的;鈮A。

圖3 多種生物基質(zhì)中不同類型的飽和(sAC)、不飽和(uAC)、羥基化(AC-OH)、羧化(AC-DC)與共軛;鈮A(CAC)的濃度(c)。其中粗線(sum)與細(xì)線表示每類總濃度與每種濃度分布。
全文總結(jié)
建立的高通量UPLC-MS方法可實(shí)現(xiàn)多種生物基質(zhì)中數(shù)百種;鈮A和共軛;鈮A的定量分析。同時(shí),構(gòu)建的定量結(jié)構(gòu)-保留關(guān)系模型,可用于無標(biāo)準(zhǔn)品條件下;鈮A的tR值預(yù)測。最后,該定量方法通過量化2種人源生物體液與5種小鼠組織中500多種;鈮A,不僅為這些生物基質(zhì)的分子表型提供了數(shù)據(jù),也為大型隊(duì)列疾病研究提供了一種重要且可靠的分析技術(shù)。多種生物基質(zhì)的高通量高覆蓋;鈮A定量方法于2023年10月發(fā)表在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域期刊J Pharm Anal上(online)。